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合成路线规划 用户指南

1. 算法简介

利用蒙特卡洛树搜索的方法直到遇到可以购买的化合物或者达到了搜索的最大次数停止。算法目前训练是基于公开的美国专利数据库 USPTO 48 万数据集,算法优化还在进行中。

2. 使用流程

2.1 输入SMILES表达式

通过文本框输入一个SMILES表达式,或点击文本框末端的“DRAW”图标,在弹出的编辑器中画出分子,点击“确认”后转换成SMILES显示在文本框中。

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2.2 提交任务

完成上述步骤后,点击“提交”按钮即可提交任务,显示“任务创建成功”表示提交成功。

这个过程需要等待40分钟或以上,根据用户输入分子的结构复杂程度时间会有不同,请耐心等候。

为了合理的分配有限的资源,我们对用户的任务额度进行了一定的限制,鼠标悬停在“提交”按钮上可以看到限制情况与使用情况。在提交次数不足的情况下无法点击“提交”按钮。

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3. 查看结果

3.1 查询历史记录

在提交任务下方的“最近运行历史”中查看最近10条任务状态;也可以点击“所有历史”查看所有历史记录。

未完成的任务会有进度条提示任务进度。

只有完成的任务可以进行“查看”操作。

只有完成/等待中/失败任务可以被删除,运行中的任务无法删除(无法中止任务释放计算资源)。

点击“运行状态”旁的下拉箭头,可以根据任务运行状态进行筛选。

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3.2 查看结果详情

在历史记录上点击“查看”按钮可以查看任务结果。

对于给定的目标分子,通常会给出top-10的合成路线预测结果,如下图所示:

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针对特定的路线,点击全屏按钮后,可以对反应预测的终点进一步的展开(算法默认是找到已知的分子或者是商业可以购买的原料就会到达预测终点)。

如下图所示,点击带有“➕ ”的分子的分子卡片可以进一步展开该分子:

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点击带有“➖ ”的分子的分子卡片可以对其他路线进行查看,或者收回展开的结果:

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3.3 下载任务结果

在查看任务界面点击“导出方案”来保存预测结果为jpeg文件。

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